2014年，在长江工会关心下，“林莉创新工作室”创建，工作室以长科院水环境所水环境治理研究室长江委“青年文明号”和长科院“环境友好型湖库治理技术”创新团队诶核心组建。2017年由长江工会正式授牌，2018年被湖北省总工会命名为“省级创新工作室”，2019年省级为“湖北省示范性职工（劳模、工匠）创新工作室”，是长江委首个省级示范工作室。

       创新工作室立足于长江流域河湖（库）水环境保护，着眼于水安全保障科学问题和技术难题，培育和造就一支知识型、技术型、创新型的高素质青年水利人才队伍，对流域水环境热点问题开展科学研究，为长江大保护提供科技支撑。

       林莉为创新工作室团队带头人，现担任长江科学院流域水环境研究所所长，从事流域水环境治理与水资源保护研究。团队现有核心成员3名，外围人员6名；其中正高2名、高工3名、工程师4名；博士6人、硕士3人，年龄全部在40周岁以下。

       团队负责人为汤显强正高，共有固定成员5人，其中博士3人，硕士2人。

       团队聚焦长江流域河湖底质生境演变及生物响应，以河湖底质生境保护和功能提升为主要目标。研发基于泥-水分离与孔隙水定深分层采样的河湖污染底质原位监测设备；研究水量短缺型河湖水生植被消退和底栖生物优势种更迭的生态水文响应机制，探究污染型底质生境对沉水植被和底栖生物生长繁衍的胁迫机制；揭示冲刷/淤积型河流底质生境演变的水生生物自适应机制；提出河湖生境保护方案，研发泥-污分离的河湖污染底质原位电动修复技术与设备。

       团队主持承担国家自然科学基金项目3项、亚洲开发银行技术援助国际项目1项，国家重点研发计划课题1项、专题5项，湖北省技术创新重大专项1项，湖北省自然科学基金青年基金1项。获湖北省科技进步奖一等奖等省部级科技奖励4项，出版专著4部，发表SCI/EI收录学术论文60余篇，授权国家发明专利20余项、水利先进实用技术推广证书4项，参编国际指南/手册1部。